动物科技学院拥有兽医学和畜牧学两个学科。
兽医学学科为一级学科博士授权点，主要有4个研究方向，分别是动物疾病与应激、动物疫病诊断与防治、动物代谢病与营养调控、动物药物研究与开发。其下设的二级学科分别为基础兽医学、预防兽医学、临床兽医学博士、硕士授权点。同时，兽医学学科为省重点学科和省领军人才梯队团队；三个二级学科均是黑龙江省农垦总局领军人才梯队。
畜牧学学科主要有4个研究方向，分别是动物营养与健康养殖技术、畜禽分子遗传与繁育技术、饲料资源开发与利用、牧草生态与草原管理。畜牧学学科下设动物遗传育种与繁殖、动物营养与饲料科学两个二级学科硕士授权点；反刍动物营养、单胃动物营养两个团队均是黑龙江省农垦总局领军人才梯队。本学科拥有的“畜禽健康养殖技术体系创新团队”于2010年获批省教育厅科技创新团队。